Los residuos químicos peligrosos que se generan en los laboratorios se clasifican en diferentes grupos teniendo en cuenta las propiedades fisicoquímicas y las reacciones de incompatibilidad:

• Grupo I: disolventes halogenados. Son líquidos orgánicos que contienen más del 2 % de algún elemento halógeno. En general son muy tóxicos e irritantes y en algún caso carcinogénico como el del percloroetileno.
• Grupo II: disolventes no halogenados. Son líquidos orgánicos con un contenido de halógenos inferior al 2 %. Son inflamables y tóxicos. Se encuentran entre este grupo los alcoholes, aldehídos, cetonas, ésteres e hidrocarburos aromáticos.
• Grupo III: soluciones acuosas. Es un grupo muy amplio que se divide en dos subgrupos: Soluciones inorgánicas y soluciones orgánicas. Dentro de las soluciones acuosas inorgánicas se incluyen las soluciones acuosas básicas, soluciones de metales pesados, de cromo VI y los reveladores. Dentro del subgrupo de las soluciones acuosas orgánicas se incluyen las soluciones de colorantes, soluciones de fijadores orgánicos y las mezclas de agua y disolvente.
• Grupo IV: ácidos. Pertenecen a este grupo los ácidos inorgánicos y las soluciones acuosas con una concentración de más del 10 % de volumen de ácido.
• Grupo V: aceites. Pertenecen a este grupo los aceites minerales de operaciones de mantenimiento y baños calefactores.
• Grupo VI: sólidos. Pertenecen este grupo productos orgánicos e inorgánicos y el material desechable contaminado.
• Grupo VII: especiales. A este grupo pertenecen los productos que por su elevada peligrosidad no pueden mezclarse con residuos de otros grupos. Por ejemplo: Productos puros caducados, residuos de comburentes, compuestos pirofóricos, compuestos muy reactivos, muy tóxicos y compuestos no identificados.

Para facilitar su separación en los contenedores de residuos peligrosos se puede seguir el código de colores identificativos que se recomienda.