¿En qué se diferencia la inicialización de arrays unidimensionales de arrays multidimensionales? En muy poco. La inicialización de los arrays multidimensionales es igual que la de los arrays unidimensionales.

Para que una función retorne un array multidimensional, se hace igual que en arrays unidimensionales. Simplemente hay que poner el tipo de dato seguido del número de corchetes correspondiente, según el número de dimensiones del array. Eso claro, hay que ponerlo en la definición del método:

int[][] inicializarArray (int n, int m)

{

     int[][] ret=new int[n][m];

     for (int i=0;i<n;i++)

          for (int j=0;j<m;j++)

               ret[i][j]=n*m;

     return ret;

}

También se puede inicializar un array multidimensional usando las llaves, poniendo después de la declaración del array un símbolo de igual, y encerrado entre llaves los diferentes valores del array separados por comas, con la salvedad de que hay que poner unas llaves nuevas cada vez que haya que poner los datos de una nueva dimensión, lo mejor es verlo con un ejemplo:

int[][] a2d={{0,1,2},{3,4,5},{6,7,8},{9,10,11}};

int[][][] a3d={{{0,1},{2,3}},{{0,1},{2,3}}};

El primer array anterior sería un array de 4 por 3 y el siguiente sería un array de 2x2x2. Como puedes observar esta notación a partir de 3 dimensiones ya es muy liosa y normalmente no se usa. Utilizando esta notación también podemos inicializar rápidamente arrays irregulares, simplemente poniendo separados por comas los elementos que tiene cada dimensión:

int[][] i2d={{0,1},{0,1,2},{0,1,2,3},{0,1,2,3,4},{0,1,2,3,4,5}};

int[][][] i3d={ { {0,1},{0,2} } , {{0,1,3}} , {{0,3,4},{0,1,5} } };