Las Confederaciones Hidrográficas son el máximo órgano gestor de las diferentes Demarcaciones Hidrológicas. Estas demarcaciones surgen impulsadas desde la esfera europea, ante la realidad de que los límites de las cuencas hidrológicas no siempre coinciden con los límites administrativos de un territorio nacional, y por lo tanto la gestión de un recurso hidrológico requiere una coordinación específica.
Se conforman pues dos niveles de organización:
- CONDEFERACIONES HIDROGRÁFICAS
Las Confederaciones Hidrográficas, gestionan y protegen la titularidad del Dominio Público Hidráulico correspondiente a su Demarcación Hidrográfica, y su ámbito de gestión suele ser Supra Comunitario o incluso Inter Estatal, requiriendo labores de coordinación con organismos portugueses y franceses.
- CUENCAS INTRACOMUNITARIAS:
Son cuencas hidrológicas que corresponden por entero al territorio administrativo de una Comunidad Autónoma, por lo que su gestión corresponde al propio Gobierno Autonómico.
Estos organismos asumen las funciones de:
- Administración y control de las aguas de los ríos, embalses, pantanos, lagos y aguas subterráneas de su demarcación
- Elaboración, seguimiento y revisión de los Planes Hidrológicos de la demarcación.
